‘1억여’, ‘100여’는 “합성어 및 파생어에서, 앞 단어나 접두사의 끝이 자음이고 뒤 단어나 접미사의 첫음절이 '이, 야, 여, 요, 유'인 경우에는, 'ㄴ' 음을 첨가하여 [니, 냐, 녀, 뇨, 뉴]로 발음한다.”라고 명시한 '표준 발음법' 제7장 음의 첨가, 제29항에 부합하는 경우이므로, ‘ㄴ'을 첨가하여 발음하는 것이 원칙입니다. 다만 ‘ㄴ’ 음의 첨가 현상은 일률적이지 않기 때문에 ‘ㄴ’ 음을 첨가하여 발음하되, 표기대로 발음할 수 있다는 '다만' 조항이 제시돼 있다는 점을 참고하시기 바랍니다.
출처: 국립국어원