'설립연도', '일차연도'가 맞습니다. 《한글 맞춤법》제10 항에는 한자음 '녀, 뇨, 뉴, 니'가 단어 첫머리에 올 적에는 '여, 요, 유, 이'로 적고, 단어의 첫머리가 아닐 경우에는 본음대로 적도록 하고 있습니다. 또한 '新女性, 空念佛, 男尊女卑'와 같이 접두사처럼 쓰이는 한자가 붙어서 된 말이나 합성어에서는 뒷말의 첫소리가 'ㄴ' 소리로 나더라도 두음 법칙에 따라 '신여성, 공염불, 남존여비'로 적도록 규정하고 있습니다.
이에 따르면 '設立年度, 一次年度'는 각각 '設立+年度, 一次+年度'의 구조로 분석되는 합성어이기 때문에 '설립연도, 일차연도'로 적어야 옳습니다. 다만 《한글 맞춤법 해설》에서 예외를 인정한 것처럼 같은 '年度'라 하더라도 '新年+度, 舊年+度'와 같이 분석되는 합성어에 있어서는 '신년도, 구년도'로 적어야 한다는 점에도 유의해야 합니다.
출처: 국립국어원